Skipers, Kovaļskis, Riko un Ierindnieks apvieno spēkus ar slepenu organizāciju Ziemeļvējš, lai neļautu ļaundarim Dr. Oktīvijam Brīzem iznīcināt mūsu planētu.
Pagājis pusgads kopš filmā "Meklējot Nemo" atainotajiem notikumiem. Nemo draudzene Dorija, kurai ir regulāri atmiņas traucējumi, negaidīti atceras savu bērnību un to, ka kādreiz ir bijusi šķirta no vecākiem. Nolēmusi atrast savu ģimeni, Dorija dodas piedzīvojumiem bagātā...
Kad viņas pasauli pārņem tumsa, kādai meitenei ir jāpārvar bailes un jādodas uz noslēpumainu gaismas pilsētu, lai izglābtu tēvu no bīstama zinātnieka un novērstu savas planētas iznīcību.
